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Embedding Hook에 대해 알아보자 (+PointLLM을 사용해보며) 우선 embedding hook에 대해 설명하기 위해선 huggingface transformers framework를 알아야 한다. HuggingFace Transformers: LLM,Vision 모델, Audio 모델을 일관된 인터페이스로 로딩,학습,추론하게 해주는 프레임 워크 ex)[추론(generate) 관리]: beam search, sampling, decoding, attention mask 생성, past_key_values 관리, stopping criteria[tokenizer 관리]: 텍스트를 토큰 ID로 변환, special tokens 등록, padding,truncation 제어[모델 구조 통일]: LLaMA, GPT, OPT, T5 등 서로 다른 모델을 같은 API로 호출[f..
LLM2Vec : Large Language Models Are Secretly Powerful Text Encoders https://openreview.net/forum?id=IW1PR7vEBf#discussion LLM2Vec: Large Language Models Are Secretly Powerful Text EncodersLarge decoder-only language models (LLMs) are the state-of-the-art models on most of today's NLP tasks and benchmarks. Yet, the community is only slowly adopting these models for text embedding...openreview.net LLM2Vec의 논문은 잘 만들어진 llm decoder를 통해 효과적인 embedding으로 사용하는 간단한 uns..
눈물을 머금고 서버 이사하기 연구실 서버를 사용 중인데 연구실 사정 상 기존 서버에서 다른 서버에서 작업을 하게 되었어요..아직 서버를 다루는 게 익숙치 않아서 차근차근 지피티와 알아보았습니다 :) 현재 내 상황 서버4번에 있는 soojin container에서 myenv conda 가상환경을 바탕으로 작업 진행 중=> 서버 5번으로 옮기기 image를 전체로 옮기거나 훨씬 더 간편한 방법이 있을 수 있지만 저는 서버4번에서 새로운 container를 파서 기존의 myenv conda 가상환경을 갖고오고 다른 데이터셋이나 파일들도 갖고오기로 했어요  [서버5번 container] ↓ (export)[서버5번 host /home/soojin/myenv.yml] ↓ (rsync)[서버4번 host /home/soojinhwa..
Huggingface token 만들고 접근 권한 얻기 huggingface-cli login - 로그인 성공했고, 모델 다운로드 가능! (from_pretrained() 정상 작동)- Git Credential Helper가 없어서, Hugging Face Hub에 모델을 push할 때는 다시 로그인해야 할 수도 있음- Git을 통한 모델 업로드가 필요하면 git config --global credential.helper store 설정 추가 가능 만약 Git을 통해 모델을 push하거나 repo를 관리할 계획이 있다면, Git Credential Helper를 설정하기1. 터미널에서 실행 git config --global credential.helper store 2. Hugging Face에 다시 로그인 후 테스트huggingface-cli l..
OASIS dataset 사용해보기 (2) OASIS-3 사용 OASIS dataset에 대해 궁금하신 분은 이전 글들을 참고해주세요 !참고로 oasis dataset에 대한 설명은 https://github.com/NrgXnat/oasis-scripts 에서 확인하시면 됩니다  그래도 간단히 설명을 하자면 OASIS-1과 OASIS-2는 바로 사용이 가능한 데이터셋이고 OASIS-1은 cross-sectional, OASIS-2는 longitudinal 데이터 셋입니다. OASIS-3는 normal aging과 alzhiemer's disease에 대한 longitudinal neuroimaging, clinical, cognitive, biomarker dataset이 존재하는 대용량의 dataset입니다.  OASIS-3에 대한 간단한 설명- 총 1378명 (..
OASIS dataset 사용해보기 (1) dataset 접근 권한 요청하기 OASIS dataset이 무엇인지 궁금하신 분들은 이전 게시글 참고해주세요 우선 OASIS 사이트에 접속합니다https://sites.wustl.edu/oasisbrains/ Open Access Series of Imaging Studies (OASIS)OASIS Brainssites.wustl.edu  사이트에 들어가시면 우측에 OASIS 버전 선택이 가능합니다 OASIS-4는 기억장애나 치매로 판단된 sample들만 모아놓은 dataset입니다. 저는 normal을 포함해 여러 단계의 alzheimer를 classification하는 것을 다룰 예정이기 때문에 OASIS-3을 받을거에요.  원하는 버전을 클릭하면 이렇게 노란 칸에 "Request Access To Datasets"이 나옵니다.  ..
Alzheimer Dataset 종류 간단히 알아보기 안녕하세요 오늘은 alzheimer의 dataset에 대해 간단히 알아보겠습니다.   Alzheimer Disease에 사용되는 대표적인 dataset은 크게 2가지가 존재합니다. OASIS와 ADNI dataset인데요. 제가 챗지피티를 괴롭혀서 알아낸 내용들이기 때문에 부정확할 수 있다는 점 참고부탁드려요  1. OASIS (Open Access Series of Imaing Studies) dataset주요 목적주로 노화 과정과 알츠하이머 병의 진행을 연구하는 데 사용됩니다. 60세부터 96세 사이의 노인들을 대상으로 하며, 정상적인 노화, 경도인지장애(MCI), 그리고 알츠하이머병을 포함하는 데이터를 제공합니다. 데이터MRI scan, clinical assessments와 demographic ..
MediCLIP : Adapting CLIP for Few-shot Medical Image Anomaly Detection https://arxiv.org/abs/2405.11315 MediCLIP: Adapting CLIP for Few-shot Medical Image Anomaly DetectionIn the field of medical decision-making, precise anomaly detection in medical imaging plays a pivotal role in aiding clinicians. However, previous work is reliant on large-scale datasets for training anomaly detection models, which increases the developmenarxiv.org(anomaly detection task) Abstrac..